净觉寺始建于明洪武二十一年（公元1388），系朱元璋敕建，其建筑规模宏大。郑和七下西洋前夕，奏请明宣宗重修使规模再次扩大，占地达40余亩。

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草桥清真寺因临内秦淮河西古草桥而得名，与净觉寺相距一华里。原寺始建于清乾隆年间（1736—1794），太平天国时期被焚，同治年初（1866）重建，建筑为中式庭院风格，占地12700平方米。

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吉兆营清真寺位于南京城市主干道中山路东侧吉兆营43号。原为中式庭院建筑占地1.2亩。始建清乾隆三十五年(1770)礼拜大殿与对厅均为大屋顶，南侧入寺甬道、北侧水房、殡舍俱全。太平天国时被焚毁。

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六合南门清真寺位于六城镇南门清真街北首，门前临滁河。始建于明永乐二年（1404），原占地5000平方米，房屋38间，整体建筑格局江南庭院三进。至2000年退还时仅余礼拜大殿和一株古柏相伴。殿年久失修，属险房不能使用。

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六合竹镇为南京回族镇，目前尚存位于王家巷寺，故竹镇清真寺也称王家巷清真寺。寺始建于清光绪二十七年（1901）由竹镇穆斯林通过在宁、沪回商筹资建成，为南北东三院落组成，占地约1200平方米。“

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长江路清真寺位于六城镇（坊称城内）雄州衙道长江路30号。此地古名澄清坊，故亦称澄清坊清真寺。寺始建于明永乐二十二年（1424），占地六亩。计有房屋41间，附设 “葆真小学” 。

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江宁区湖熟镇是南京古文化起源地之一，这里祖居回族世家，并以粮业、鸭业生存。明洪武年间在水北繁华街建寺，故湖熟寺亦称水北清真寺。

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民国初年因大批市内回族工商户赴溧水采购粮食、禽蛋后逐定居在县城小西门魏家塘一带，逐集资建寺一座，故寺又称小西门寺、魏家塘寺。寺规模不大，三间平瓦房连同院落约400平方米。

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浦口区星甸清真寺始建于清乾隆六年（1741），时占地60平方米，仅有房屋三间。至光绪十六年（1890）公推执教阿訇等赴宁、沪、皖筹资使寺占地570米方米，大殿三间，平房五间使寺的规模大增。经“文化革命”寺被强占为民宅。

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江浦清真寺位于镇中心江浦街道，以巷称乎而得名。寺始建约于1929年前，占地约160平方米。除礼拜大殿三间外还有水房、水井、披间、殡舍等，置寺产田地20余亩以供寺的正常开支，回族穆斯林千人。寺延聘一位阿訇执教，至上世纪50年代被侵占为民宅。

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